Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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