Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms