Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms