Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrimpolQ6P1E7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms