Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zmiz1Q6P1E1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms