Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc3bQ6NWW9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms