Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParpbpQ6IRT3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms