Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop58Q6DFW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms