Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tmcc1Q69ZZ6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmcc1Q69ZZ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmcc1Q69ZZ6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmcc1Q69ZZ6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc1Q69ZZ6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms