Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Pdzrn3Q69ZS0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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