Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms