Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms