Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2bQ64511 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms