Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt12Q64291 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms