Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit1Q64282 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms