Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PatjQ63ZW7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms