Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms