Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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