Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms