Protein–RNA interactions for Protein: Q62168

Krt32, Keratin, type I cuticular Ha2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt32Q62168 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt32Q62168 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt32Q62168 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms