Protein–RNA interactions for Protein: Q62165

Dag1, Dystroglycan, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dag1Q62165 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dag1Q62165 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dag1Q62165 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms