Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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