Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApcQ61315 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcQ61315 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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ApcQ61315 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ApcQ61315 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ApcQ61315 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ApcQ61315 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcQ61315 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms