Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc6Q61143 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms