Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P4ha2Q60716 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms