Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms