Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms