Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms