Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms