Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms