Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms