Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms