Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms