Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms