Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afap1l2Q5DTU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afap1l2Q5DTU0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms