Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Scn2bQ56A07 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Scn2bQ56A07 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Scn2bQ56A07 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Scn2bQ56A07 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Scn2bQ56A07 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn2bQ56A07 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn2bQ56A07 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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