Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spire1Q52KF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms