Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms