Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Snhg11Q4G0K9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Snhg11Q4G0K9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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