Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne3Q4FZC9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms