Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm44Q3V089 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm44Q3V089 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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