Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrfip1Q3UZ39 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms