Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms