Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms