Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms