Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1lQ3USQ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms