Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog7Q3UM29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms