Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smu1Q3UKJ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms