Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms