Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pid1Q3UBG2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms